阿裏雲智能達摩院-新冠肺炎全基因組測序智能分析

解決方案及特色

基因組檢測需要做到快速準確，對海量測序數據做到快速分析需要強大的計算和存儲係統。依托阿裏雲強大的雲平台，支持線上和本地化大數據套件部署。
基因組數據分析方麵，主要提供並行、分布式的大數據分析係統。功能包括序列質控、序列比對、序列拚接。每個步驟經過優化設計和參數調優使得對於 CPU 和內存的利用更為高效，從而有效減少了數據分析的時間。此外，係統提供友好界麵，並支持一鍵出分析報告功能。
除了病原體檢測之外，對於不同來源病原體的序列和結構分析有助於實現病原體的朔源和對應藥物分析。進化分析以及基於深度學習的人工智能算法能夠加速並且精準實現預期目的。
係統采用雲架構，支持線上和用戶本地部署。配合阿裏雲專有雲的 Iaas 和 Paas 係統，快速搭建大數據平台。該平台采用分布式存儲和分布式計算係統，有效解決基因測序數據量大，分析計算需要分布式或並行方式的特點。基於該大數據平台，分析速度能有效提升 4~10 倍，人工智能分析處理速度也大幅提升。

應用與效果

全基因組測序技術在全國進行應用實踐。阿裏達摩院在浙江省疾控中心和武漢金銀潭醫院做試點應用，效果不錯，整體準確率非常高。